高等教育研究所的前身要追溯到1985年广东工学院成立的高等教育研究室和1987年广东机械学院成立的高等教育研究室。广东工学院、广东机械学院、华南建设学院东院合并组成广东工业大学后，高等教育研究所于1996年成立，为正处级建制单位。高等教育研究所创办广东省连续性内部出版物《高等工程教育研究》，发表高等教育研究和教育教学改革论文300多篇；2001年申请到公开刊号创刊《广东工业大学学报（社会科学版）》，刊物重点设置“高等教育研究”和“教育教学改革”等栏目。高等教育研究所和《广东工业大学学报（社会科学版）》编辑部实行“一套人马，两块牌子”对外办公。高等教育研究所先后承担教育部重点课题、广东省政府重大课题、广东省教育科学重大课题、广东省委省政府涉台研究（高等教育）工作重点课题，参与广州大学城建设、南方教育高地建设等重要工作论证。2005年10月，高等教育研究所评为“首届全国优秀高等教育研究机构”。2010年10月，《广东工业大学学报（社会科学版）》被评为“全国高校优秀社科期刊”。2011年，高等教育研究所行政挂靠教务处，业务和经费独立核算；《广东工业大学学报（社会科学版）》编辑部并入期刊中心。2014年9月25日，学校发文（广工大党字[2014]29号）增设发展规划处，高等教育研究所机构保留，与发展规划处合署办公。

历届人员:

1.高等教育研究所历任主管校领导（1996－）

郑德涛，博士，教授，时任广东工业大学副校长；

黄慧民，博士，教授，时任广东工业大学副校长；

钟 韶，教授，时任广东工业大学校长；

张湘伟，博士，教授，时任广东工业大学校长；

骆少明，博士，教授，时任任广东工业大学副校长；

章 云，博士，教授，时任广东工业大学副校长；

余 林，博士，教授，广东工业大学副校长。

2.曾在高等教育研究所（室）任职的工作人员

罗德明，教授，原广东工学院院长，高教室主任；

卢茂林，副教授，原高等教育研究所副所长；

陈传瑶（女），助理研究员；

李益民，原广东工学院教务处副处长，隆辉分院副院长；

黄燊华，教授，原广东工学院副院长，高教室主任；

王德中，副研究员，原广东工学院教务处处长；

郑德涛，教授，原广东工学院副院长，高教室主任；

罗晋镜，副教授，原《高等工程教育研究》杂志主编；

程志澄，副研究员；

丘活伦，原广东工学院教务处副处长；

郭仁义，研究员，原广东工学院党委书记；

罗振民，副教授，原广东机械学院高教室主任；

吴绍玉（女），副科级；

周佩娟（女），助理研究员，原广东工学院高教室副主任；

江保松，硕士，助理研究员；

姚立宁，教授，原高等教育研究所所长；

叶 彬（女），讲师，正处级调研员；

彭先进，教授，原高等教育研究所所长；

黄慧民，博士，教授，原广东工业大学副校长，高等教育研究所所长；

何秀成，研究员，原高等教育研究所所长，《广东工业大学学报（社会科学版）》常务副主编；

骆洁嫦（女），副研究员；

贾俊兰（女），副研究员；

王香丽（女），博士，副研究员；

邹 红（女），硕士，副研究员；

王丽华（女），副研究馆员。